1995年2月22日，上海大学生命科学学院在原上海科学技术大学生物工程系的基础上改组成立，由原中国科学院上海生理研究所所长杨雄里院士兼任院长，2003年由原中国科学院植物生理生态研究所所长许政暟研究员接任院长直至2008年5月，2008年11月-2011年由原南京大学生物化学系系主任李根喜教授接任院长，2012-2014年学院行政工作由院党委书记沈忠明主持。2014年11月起由中国科学院生物化学与细胞生物学研究所丁建平研究员接任院长。2017年10月9日起由加州大学洛杉矶分校医学中心心脏内科、心脏外科终身教授沈路一接任院长。据2018年7月学院官网显示，学院下设植物学系、神经生物学系、生物化学