可以侵染果实、茎秆，有时可以与花叶病毒病混发，在叶片同时表现出花叶，如果只发生条斑病毒病，很少侵染叶片，所以很多菜农朋友对果实发病症状有时分辨不清，以为是细菌性病害。辣椒黄化条斑病，病株生长点附近叶片上产生畸形、褪绿或花叶，后形成不明显的轮纹。生长点四周茎上生褐色条斑，纵剖维管束变褐，茎基部表皮也变褐，与疫病症状相近。果实染病 产生轻微花斑，畸形或产生不规则的褐色坏死斑，生长点枯死是该病特点。番茄斑萎病毒引起的辣椒黄化条斑病的症状易变，有些品种在顶端嫩茎上产生系统坏死和落叶，落叶后又长出的新叶现系统花斑或严重变形，早期染病植株严重矮化。