福建医学院的前身是福建省立医学专科学校。民国26年(1937年)6月创办于福州市，同年10月，福建省立医院划为该校附属医院。民国27年6月，因抗日战争迁往闽北沙县。同年8月，定名为福建省立医学院，学制6年，毕业生授医学士学位。抗日战争胜利后，迁回福州，在省立医院和高级工业职业学校旧址(吉祥山)重建校舍，医科学习年限为6年，医学专修科为5年。当时仅有基础学科教师19人，兼职教师3人。解放前夕，基础学科仅有专任教师15人。附属医院设病床30张，有临床教师12人，在校学生294人。解放前毕业生共279人。