辣椒枯萎病发生时，叶片自下而上逐渐变黄，大量脱落。与地面接触的茎基部皮层呈水浸状腐烂，地上部茎叶迅速凋萎。有时病情只在茎的一侧发展，形成条状坏死区，后期全株枯死。地下根系呈水浸状软腐，皮层极易剥落，从茎基部纵剖，可见维管束变为褐色。在湿度大的条件下，病部常产生白色或蓝绿色的霉状物。病原为半知菌亚门的尖镰孢菌辣椒专化型〔Fusariumoxysporumf.sp.vasinfectum(Atk.)SynderetHansen〕。病菌以菌丝体和厚垣孢子随病残体在土中越冬，可营多年腐生生活。病菌从须根、根毛或伤口侵入，在寄主根茎维管束繁殖、蔓延，并产生有毒物质随输导组织扩散，毒化寄主细胞，或堵塞导管