肠道真菌(gut fungi),理学-生物学-微生物学-微生物分类学-〔真菌的分类〕,共生在牛、羊、鹿和骆驼等大型食草动物消化道中的真菌。肠道真菌可以分泌多种纤维素酶、半纤维素酶、纤维二糖水解酶、蛋白酶等,帮助食草动物消化纤维素及其他植物细胞壁组分,在降解饲料,特别是大颗粒、大片段植物纤维过程中起着重要作用。其生长温度和酸碱度范围狭窄(33~41℃,pH值6.5~6.8),且严格厌氧。肠道真菌属于真菌界新丽鞭毛菌门(Neocallimastigomycota),其中只有单个目和单个科,即新丽鞭毛菌目(Neocallimastigales)新丽鞭毛菌科(Neocallimastigaceae)。已在10个科的30多种动物中分离或检测到肠道真菌,常见的含肠道真菌的草食动物包括绵羊、山羊、牦牛、黄牛和水牛等。已分离鉴定出的肠道真菌有8个属约20种。肠道真菌的生活史主要由两个阶段构成:①附着在营养基质上的不动的营养体阶段。当具有鞭毛的游动孢子与营养基质接触后,鞭毛脱落,游动孢子形成假根侵入营养基质,细胞体通过多次有丝分裂逐步变大。②具有鞭毛和运动能力的游动孢子阶段。