香薷球针壳菌丝体叶背生，易消失或暂存留，散生或形成斑块；分生孢子单独顶生，纺锤形，49- 74×14-25（平均62.9×21.9）μm；子囊果密聚生或由聚生到散生，扁球形。菌丝体叶背生，易消失或暂存留，散生或形成斑块；分生孢子单独顶生，纺锤形，49- 74×14-25（平均62.9×21.9）μm；子囊果密聚生或由聚生到散生，扁球形，直径153- 229（平均191.7）μm，多为167-210μm，附属丝4-14根，常为7-10根，挺直，针形，顶端钝圆，基部膨大成球形，球宽37-44μm，有时中部也出现膨大现象，长135-582μm，为子囊果直径的1.0-3.1倍，常为2.5倍左右，无隔膜，透明；子囊7-23个，多为10-15 个，长椭圆形或卵形，71-94×27-39μm；子囊孢子2个，椭圆形至长椭圆形，24.6- 39.5×14.8-24.6μm。