西门国小创校于民国二年四月，当时称之为安平寻常小学校，校址设于安平古堡的前面(即位于现在的安平开台天后宫)，后来改名为安平寻常高等小学校(专门供日本子弟就读学校)。民国三十四年四月改名为台南市安平国民学校，民国三十五年二月改名为台南市第二国民学校，民国三十六年二月改名为台南市安平区西门国民学校，民国五十七年八月政府全面实施九年国民义务教育，将该校正名为台南市安平区西门国民小学，一直沿用至今。学校草创迄今已超过九十四个寒暑，可算是历史攸久的学校。因时过境迁，加上安平区多次洪水，盐水溪决堤，校舍受创严重，旧建筑不复存在，目前尚留有朝北方向旧校门遗址及几棵老榕树，也因为有了它们的庇佑，加上历任校长的