会计学院是2000年在原兰州商学院会计学系、审计学系合并重组的基础上诞生的。2001年在院校合并中又并入了原甘肃省职工财经学院会计学系。目前，会计学院是兰州商学院最大的二级学院，也是最早培养会计学专业本科及硕士研究生的教学单位。会计学院的前身是1981年成立的兰州商学院会计学系，2000年成立会计学院。会计学于1997年被确立为校级重点学科，1998年被确立为省级重点学科，现已完成三轮省级重点学科建设任务，是兰州商学院最早的省级重点学科之一。2003年经国务院学位办批准获得会计学硕士学位授予资格，2008年会计学被教育部确定为国家级特色专业建设点，2010年经国务院学位办批准获得全日制会计硕士