土壤蛋白组学

土壤蛋白组学（soil proteomics），农学-农业资源与环境-土壤学-[土壤微生物作用]-[土壤生物研究方法]-土壤蛋白组学，对于土壤环境混合微生物群落中所有微生物的蛋白质组总和的研究。又称土壤宏蛋白质组学。土壤蛋白质组学是针对某一特定土壤样品微生物群落所产生的全部蛋白质而进行大规模研究的方法，其测定的是某一特定区域的土壤微生物群落所产生或修饰的全部蛋白质。其数目和水平随着时间、需求、外界压力及物种组成的不同而产生变化。由于蛋白质是土壤微生物的重要组成部分，扮演着微生物生命活动中执行者的角色，因而蛋白质的表达是特定生态系统下具体微生物活性的反映，具有探究天然复杂系统（如土壤）的潜力。土壤蛋白质组学可在细胞内水平上提供功能信息，在微生物群落功能分析过程中具有很大潜力。土壤蛋白组学利用基于凝胶（一维和两维）和非凝胶液相色谱分离的研究方法，而这两者都依赖于基于质谱分析的肽识别方法。然而质谱分析受到土壤基质复杂性的限制。土壤基质具有反应性、结构性以及蕴含极其多样化的微生物群落等特点，通常处于异质生理状态且通常无法表征。这给土壤蛋白组学的研究带来了一定的挑战和困难。