法鼓佛教学院是由圣严法师所创立的中华佛学研究所,于2006年,依据“私立学校法”第九条修正︰允许设立单一宗教的“宗教研修学院”法源,向教育部申请成立。于2007年4月8日(佛诞节),举行“成立揭牌暨首任校长就职典礼”,成为我国第一所纳入高等教育体系的宗教研修学院,名为“法鼓佛教研修学院”。之后,依据教育部于2007年三月召开研订“宗教研修学院设立办法草案”会议决议:宗教研修学院及其系、所、学位学程,均应冠以该学院所属宗教惯用之名称,不硬性规定冠以“研修”之文字。因此,本校报请教育部自2008学年度起(8月1日)核可,更名为“法鼓佛教学院”。法鼓佛教学院前身为中华佛学研究所。台湾的单一宗教教育学位始终未能获得教育部承认,中华佛学研究所二十多年来,一直在联合宗教教育界向政府争取宗教教育能纳入国家体制,在台湾大学恒清法师与中华佛学研究所李志夫所长奔走之下,终于在2004年3月,立法院三读通过修正“私立学校法”第九条。