土壤真菌(soil fungi)是指土壤中具有真核细胞的单细胞或多细胞分枝丝状体或单细胞个体，属真核生物。土壤真菌以土壤作为活动场所完成其全部或部分生活史。广义的土壤真菌还包括森林表土腐朽植物和枯枝落叶层上的真菌。常见者有藻菌纲(Phycomycetes)、子囊菌纲(Ascomyctes)、担子菌纲(Basidiomycetes)及有性世代不明的半知菌属(Fungi imperfecti)等。上述菌属大部分属于好气性腐生菌，有的则寄生在植物上并有致病性。真菌的菌丝具有分解有机物的能力，而分生孢子和厚膜孢子却几乎没有这种能力。真菌对土壤pH值的要求比放线菌和细菌所要求的为低。可以认为真菌是酸性土