荧光基团（fluorophorechromophore），理学-化学-物理化学-生物物理化学-荧光基团，能够吸收一定能量（波长）的光子，并发出荧光的化合物结构。通常含有芳香基团，或具有π键的平面杂环分子。荧光基团可以是独立的有机小分子，也可以是某一功能系统的荧光成分，如荧光蛋白中由三个氨基酸经化学修饰形成的特化结构称为生色团。生色团是指分子中含有能够对光辐射产生吸收、具有跃迁的不饱和基团及其相关的化学键。某些有机化合物分子中存在含有不饱和键的基团，能够对紫外及可见光区域内某波长光子产生吸收，且吸收系数较大。基于分子复杂性和合成方法，荧光基团分子一般可分为四类：蛋白质和多肽（如荧光蛋白）、有机小分子化合物（如染料）、合成寡聚物和聚合物（如量子点）、多组分体系。含有生色团的荧光蛋白通常会通过遗传操作与生物体内的目标蛋白融合表达，从而应用于对目标蛋白的定位和运动示踪。常见的荧光蛋白包括：蓝色荧光蛋白mTagBFP2、青色荧光蛋白mTurquoise2、绿色荧光蛋白EGFP、红色荧光蛋白mCherry/tdTomato、远红外荧光蛋白mKate2等。有机小分子荧光基团可以单独使用。