基因测序（gene sequencing），理学-化学-分析化学-生命分析化学-DNA甲基化分析，测定一个DNA分子片段内核苷或碱基精确顺序的技术。基本概念基因测序或DNA测序并没有严格意义的区分，已不再简单地指特定基因序列的测定。DNA分子由四种经典碱基组成：胸腺嘧啶（thyime; T）、腺嘌呤（adenine; A）、胞嘧啶（cytosine; C）和鸟嘌呤（guanine; G），因此，与DNA测序相同，基因测序也是测定一个DNA分子片段内核苷或碱基的精确顺序。它包括任何可测定一条链中四种碱基——腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶的排列顺序的方法或技术。