原始古紫萁是一种古紫萁属植物。木质部的管胞之间基本上连续，仅在叶迹分离处才被叶迹中断。叶隙的纵向长度很短，故木质部的横切面不显束状。木质部径向厚度小于 10 个管胞，近轴面管胞常与髓内管胞发生连接，故与髓的界限不明显。木质部为中始式。其原生木质部位置不定，管胞直径 10~15 μm；后生木质部管胞较大，中等大小的管胞直径 70~80 μm。木质部均由长管胞组成，管胞壁具梯纹加厚。混合髓内有较多管胞，它们单个或成束分布。管胞直径中心处可达 100 μm 以上。髓内管胞壁均为梯纹加厚，有的可见到有纹孔缘保存。髓内的薄壁细胞、厚壁的薄壁细胞和厚壁细胞的横切面均近似圆形，直径 50~100 μm；纵切面形状则因位置不同而异。在中柱周围组织中，内皮层保存较好。位于木质部远轴侧不远处的内皮层通常为一层细胞，稀为两层。内皮层细胞壁的加厚形式为次生状态，并可见到通道细胞。茎的内部皮层厚达 1.5 cm，除根迹和叶迹区外，主要由薄壁细胞组成。内部皮层的薄壁细胞有两种：一是完全薄壁的，其横切面为圆形，直径为 80~100 μm；纵切面为长圆形，长 100~150 μm。