赣南科学院（Gannan Academy of Sciences）是赣州市政府直属正县级事业单位。科学院为市政府直属公益性综合科研机构，是市政府为社会和产业发展提供科学试验示范、公益性技术服务的重要平台。拥有比较完整的农业科技体系，农、林、牧、渔、果等学科门类齐全。截至2018年2月，科学院拥有14个直属单位，职工总数1230人。1952年，赣州市花卉研究所建所，与赣州市甘蔗研究所，江西省甘蔗研究所三块牌子，一套人马合署办公。1955年4月，赣州市农业科学研究所建所。1959年，赣州市林业科学研究所建所。1963年8月，赣州市畜牧研究所建所。1973年，赣州市水产研究所建所。1976年，赣南树木园成立。