干细胞具有能复制并分化为造血和免疫活性细胞的能力。BMT是各种血液肿瘤、再生不良性贫血症、重度地中海型贫血症以及一些先天性免疫缺乏症或代谢性疾病救命的根本治疗方法。根据干细胞的来源不同可分为自体、同基因（syngeneic）和异基因（allogeneic）BMT。同基因骨髓移植是指同卵孪生同胞间的移植，由于供、受者在遗传学上相同，故与自体骨髓移植一样，不存在免疫不相容的问题。异基因的骨髓移植（allo-BMT）的供髓细胞在遗传上与受者细胞起源不同，与肾、肝、心等器官移植相比，allo-BMT更易发生排斥反应，而一旦供髓植活后又可发生移植物抗宿主病（GVHD），故供、受者间要进行严格的组织配型，受者在移植前必须用免疫抑制剂预处理。