清宣统元年(1909年),邮传部尚书盛宣怀鉴于"商业振兴,必借航业,航业发达,端赖人才",将南洋公学改为高等实业学堂,在南洋公学原设置的路电、土木工程专业外,又增设船政科,办航海一班。1912年成立吴淞商船学校,1929年,经停办后正式复校,定名为交通部吴淞商船专科学校,1933年更名为吴淞商船专科学校,1939年因战争被迫搬迁至重庆,更名国立重庆商船专科学校,1946年更名国立吴淞商船专科学校,1950年更名上海航务学院。校址位于上海吴淞口。伴随历史变迁,曾一度停办,最终于抗战胜利后在沪第三次复校。这所学校吴淞商船专科学校是中国高等航海教育的发轫地,中国早期航海高等学府之一,也是当今大连海事