赣南医学院药学院是在原药学系、药理学教研室基础上于2008年3月组建而成。下设药学院办公室、学生工作办公室、无机化学与物理化学教研室、有机化学教研室、药物化学教研室、天然药物化学教研室、生药学教研室、分析化学与药物分析教研室、药剂学教研室、药理学教研室、医用化学教研室、化学与药学实验室。拥有江西省高校重点实验室--"天然药物研究与开发重点实验室"。学院现有教职工39人,其中教授8人,副教授6人,副高职称以上人员占35.9%;博士4人,硕士23人,硕士学历以上人员占69.3%。其中享受国务院特殊津贴2人,江西省中青年骨干教师5人,省级学科带头人1人,硕士研究生导师7名,入选江西省百千万人才工程4