生物标记物筛选（screening of biomarker），理学-化学-分析化学-生命分析化学，从复杂的生物系统中筛选出生物标记物的方法。生物标记物是指可以标记系统、器官、组织、细胞及亚细胞结构或功能的改变或可能发生的改变的生化指标。自从1953年J.D.沃森[注]和F.H.C.克里克建立了DNA双螺旋结构模型后，生命科学研究的面貌便焕然一新。分子生物学的飞速发展极大地推动了人们从分子组成水平对生物系统进行深入的了解。20世纪70年代初，贝勒医学院发表了有关代谢轮廓分析方面的论文，采用气相色谱-质谱联用技术对类固醇、有机酸以及尿样进行分析，开创了对复杂样品进行代谢轮廓分析的先河。1982年，荷兰应用科学研究所（TNO）的J.van der格里夫首先采用质谱对尿中代谢指纹进行研究。1983年，J.K.尼科尔森[注]、M.J.白金汉和P.J.萨德勒发表了有关全血和血浆的1H-NMR谱。1997年，S.奥立佛[注]提出了通过对代谢产物的数量和定性来评估酵母基因的遗传功能及其冗余度，率先提出了代谢组的概念。