细胞微区分析（single-cell micro-zone analysis），理学-化学-分析化学-生命分析化学-细胞分析，利用各类生化方法，研究不同生理和病理条件下，单个细胞的亚细胞区域或区域细胞器表达基因、蛋白质等生物分子异同的技术。由于胞内基因组具有普遍性和均一性，而蛋白质组存在时间上的特殊性和空间上的多样性，细胞微区分析将亚细胞区域或区域细胞器的蛋白质组学作为研究的重点。采用对细胞群体分析来获得生物化学信息是统计分析的结果，它掩盖了单细胞的差异，限制了医学、生物学以及其他学科的进一步研究。细胞微区分析能够准确地提供细胞内物质及细胞内生化反应的准确信息，反映出细胞的功能与生物化学组分间的特定关系，这既可以反映细胞生理状态和过程，也可以为疾病早期诊断提供特异性的标志物，同时可以监测、跟踪疾病的发展及预后情况，并为认识疾病的发病机理、明确疾病的分型、分级、分期提供线索。