南派藏医（southern schools of traditional Tibetan medicine），医学-中医药-民族医药-藏医-〔藏医学术流派〕，公元15世纪开始在中国藏区南部以拉妥苏卡为中心，林芝与山南为主的地域内所形成的继承玉妥巴的藏医学派别。其最初创始人是旺玖扎巴大师和仁增彭措等。在藏医药史上出现了北派和南派两大医药学派别，南北二派是继两位至尊宇妥萨宁去世后出现的两大藏医药学派别。按以往智者们的说法，北派主要传承传统，南派主要传承秘法实践传统。所以在解释《四部医典》的内容、识药方法等方面有所区别。北派主要传承了论说传统，南派主要传承了实践的传统，从而形成各自的学说特色。南北两派的最初产生均是源于由至尊宇妥巴创建的同一个医药学理论体系，然后渐渐地发展成为两大不同的派别，南北两派都要学习研究和实践藏医药学的根本《四部医典》。另外，根据所处藏地南北地理环境的不同，即海拔的高低、气候的冷热、潮湿的程度、生活条件及生活习俗的不同等实际情况，生活在这两地的南北两派医药学家们之间在治疗方法、药物识别等方面形成了各自的特点和不尽相同的经验。