折叠识别（fold method），理学-生物学-生物工程-蛋白质工程-蛋白质工程-蛋白质分子设计-蛋白质理性设计-蛋白质三级结构预测，以结构已知的蛋白质的折叠子为模板，寻找给定氨基酸序列可能采取的折叠类型。又称穿线法。发展简史1987年，芬克尔斯坦[注]和普季岑[注]就指出，由于某种立体化学的限制，蛋白质折叠子的数目是有限的。后来许多学者对自然界中可能存在的折叠子数目做了评估，1992年，Chothia估计自然界中折叠子不超过1000个，1998年，王志新做了更为精确的估计，认为仅有654种折叠子存在。利用折叠识别预测蛋白质结构的主要方法大多是从1991年鲍伊[注]等提出的一维-三维剖面法（1D-3D profile）和1992年琼斯[注]等提出的穿线法上发展而来的。