兽医微生物，与动物相关的病原微生物。引发畜禽病症的重要病原体。包括细菌、放线菌、螺旋体、支原体、立克次氏体及衣原体等原核微生物，其中细菌致病的如化脓棒杆菌使大部分受创伤或免疫力低下的家畜（猪牛羊）患化脓性疾病或患肺炎、乳腺炎、流产等；羊棒杆菌（假结核棒杆菌）致使绵羊、山羊、马患淋巴炎；肾棒杆菌使牛患肾炎或猪脓肿；马棒杆菌引发驹支气管炎或猪淋巴炎；牛棒杆菌引发牛乳腺炎；猪棒杆菌致使猪患肾炎；等等。除原核病原菌外，还包括单细胞酵母型真菌和多细胞丝状型霉菌等真核微生物，以及寄生性病毒、类病毒、拟病毒、朊病毒等非细胞形态的微生物，对它们的致病性、免疫性和检测方法的研究均有重要意义。20世纪70年代人畜共患疾病，如C–J病、羊瘙痒病、库鲁病以及后来在欧洲等国家发生的疯牛病(BSE)，即牛海绵状脑病等都是由一些亚病毒分子引发的。这些疾病尚无特效药，主要靠免疫疫苗及相关生物制剂防治。21世纪的兽医微生物研究重点是：①人畜共患病的病原体类型及其传染性和致病性研究。②与现代生物技术紧密结合加强对疫病及其致病机制的揭示以及对人畜共患疾病的诊断和防治。