张芝元,四川清溪人,清朝将领。以千总从副将军明亮征金川有功,积官至越巂营参将。金川酋以番僧诇军事,芝元言於明亮曰:"军事每为贼知,非去其谍,灭贼无日矣。"会大风雪,明亮命芝元率数十人伪若以他事出者,宿番僧寺中。芝元故通番语,与僧饮甚欢,僧醉眠,芝元出寺聚柴焚之,僧皆死。贼谍断,因招降其众。寻从成都将军特成额驻兵江卡,捕夹坝,围本肯贼寨,焚其碉,毙贼甚众,擢懋功协副将。台湾林爽文为乱,芝元率屯练降番佐军。参赞海兰察等分攻大埔林、中林、大埔尾三庄,芝元为策应。贼据小半天山,将军福康安等自前山进,芝元与领队大臣普尔普领兵别为一队,夜半先发,绕大山夹攻贼后。黎明,诸军同抵山麓,攀援上,贼力拒,芝元先登