基础医学院坐落于吉林省长春市文化教育社区--朝阳区内，东邻同志街，西与吉林大学第一医院一街之隔，北邻美丽的文化广场，南与南湖公园相距不过千米。基础医学院始建于1951年5月，原为白求恩医科大学基础医学部，1992年改"部"为"院"，是吉林大学集基础医学教育与科研于一体的重要教学基地。历经五十多年的风风雨雨吹打，基础医学院在实践中不断发展壮大。学院设有人体解剖学、组织与胚胎学、生理学、生物化学、病原生物学、免疫学、病理学、病理生理学、法医学、药理学、遗传学和分子生物学等18个教研室。教育部病理生物学实验室，前列腺疾病研究中心，吉林省法医鉴定中心，卫生部川医学奖学金日语培训中心，电子显微镜实验中心