计算机辅助药物设计(computer aided drug design)是以计算机化学为基础,通过计算机的模拟、计算和预算药物与受体生物大分子之间的关系,设计和优化先导化合物的方法。计算机辅助药物设计实际上就是通过模拟和计算受体与配体的这种相互作用,进行先导化合物的优化与设计。计算机辅助药物设计大致包括活性位点分析法、数据库搜寻、全新药物设计。受体是指生物体的细胞膜上或细胞内的一种具有特异性功能的生物大分子,与内源性激素、递质或外源性药物结合后,发生一定的特定功能,如开启细胞膜上的离子通道,或激活特殊的酶,从而导致特定的生理变化。能与受体产生特异性结合的生物活性物质称为配体(ligand)。配体与受体结合能产生与激素或神经递质等相似的生理活性作用的称为激动剂;若与受体集合后阻碍了内源性物质与受体结合,从阻断了其产生生理作用的,则称为拮抗剂。计算机辅助药物设计实际上就是通过模拟和计算受体与配体的这种相互作用。进行先导化合物的优化与设计。