标记辅助基因聚合（marker-assisted gene polymerization），农学-畜牧学-[动物遗传育种]-[动物遗传]-标记辅助基因聚合，借助基因组已知标记或基因的信息，通过杂交将存在于不同品种/系的不同基因座的优良基因聚合到一个群体中，形成多基因座的理想基因型，从而培育兼具不同品种/系优良特性的优良品种/系的技术。生物物种经过长期的自然和人工选择，形成了众多各具特色的不同品种/系，它们各自既有突出的优点，同时又不可避免地存在一些缺陷。能否通过育种培育出一个新的品种/系，使其集中若干不同品种/系的主要优点，一直是育种学家的追求，但在常规育种中这几乎是不可能实现的。随着基因组技术和基因挖掘技术的发展，影响不同品种/系优良特性的主效基因逐渐被发掘，为通过杂交，结合标记辅助选择，将控制不同品种/系优良特性的基因聚合到一个基因组中提供了可能。标记辅助基因聚合的基本思路见图。图中，L1、L2、L3和L4是4个不同的品种，它们各自为g1、g2、g3和g4基因的纯合子，这些基因位于不同的基因座，每个品种除了是相应基因的纯合子外，不携带其他3个基因（如L1不携带g2、g3和g4）。