人类代谢组数据库(Human Metabolome Database;HMDB),医学-现代医学-药学领域-药理学与药代动力学-代谢组学-代谢组学数据分析-代谢组学数据库-人类代谢组数据库,由加拿大代谢组学创新中心(The Metabolomics Innovation Centre,TMIC)在2007年创建的人类代谢物数据库网站。经过了多次更新,截至2020年4月,最新版本为4.0。该网站收载了超过70000个内源性分子/代谢物,每一个化合物赋予了唯一代码。HMDB不但提供代内源性小分子的分子式、分子量等基本信息,还包含每个物质在常规生物样品中的浓度范围、生理功能及涉及代谢通路,并与基因网络数据库KEGG进行关联。是一个全面、实用的内源性物质数据库,HMDB对大量内源性小分子的来源和归属进行了较详细的归类,并根据文献整理出各化合物在不同类别人群相应生物样本、组织/器官中的浓度/含量水平,为代谢组学研究提供了非常有价值的数据。数据库还包含大量的化合物二级质谱图、气相色谱质谱图及核磁共振数据,可以为基于质谱或核磁共振(NMR)的代谢组学分析提供代谢物鉴定的参考和依据。