水产环境基因组学

水产环境基因组学（aquaculture environmental genomics），农学-渔业-水产养殖-水产遗传育种学-[水产育种生物技术]-水产分子育种-水产环境基因组学，水产相关环境全部微生物（主要是细菌）基因组及其定义的群体结构、功能、多样性和资源价值等相关研究方法、已有认知和发展过程的综合。环境基因组学研究主要有：①用海量平行测序技术测定16S rRNA基因序列，描述环境细菌多样性、群体结构和群体功能。②测定和组装环境细菌全基因组序列。③基于全部环境细菌基因，推测环境生化和代谢通路，解析环境功能。发展趋势有：①基于18S rRNA基因序列描述环境浮游动植物多样性。②将蛋白质组学、转录组学、代谢物组学等组学（omics）技术引物环境基因组学研究。③基于单细胞的各种组学分析弱化“无法培养”界限。④扩展到特定环境所有物种的基因组学研究，如动物及其病原、互生和共生生物等。环境基因组学可能更注重获取基因、酶、生物活性物质等资源，倾向构建BAC或fosmid等大片段文库。