AMBER力场(assisted model building with energy refinementAMBER) force field),理学-化学-物理化学-计算与理论化学,在分子模拟中常用的,基于能量拟合的经验性分子力学力场。自其被P.科尔曼[注]等提出以来(ffamber94),AMBER已在多年的应用之中被不断细化、充实,发展成了一个完整的力场族类。总体上而言,AMBER属于全原子力场(ffamber94~ffamber03),但其也开发过针对更大尺度体系的联合原子力场(ffamber03ua)。由于AMBER力场的初衷是服务于生物体系中的蛋白质和核酸,其各代力场间的关系可被看作是针对此类分子的不断升级与细化。其代表性版本如下:①ffamber94,AMBER的第一个版本,因在模拟中重现蛋白质的螺旋结构而成名。②ffarmber96,基于双二面角联合分布修正肽分子参数。③ffarmber99,使用新电荷算法更新氨基酸与核酸参数。④ffarmber03,结合量化和连续溶剂计算,再次修正氨基酸参数。