土壤微生物地理（soil microbial biogeography），农学-农业资源与环境-土壤学-土壤生物-土壤微生物群落演替-土壤微生物地理，研究土壤微生物在空间和时间尺度分布问题的生物地理的分支。旨在揭示环境条件、微生物群落和宏观尺度现象之间的重要联系。土壤微生物地理旨在解释土壤微生物在哪里，丰度多少以及成因，可以为研究土壤生物多样性的产生和保持（例如物种产生、灭绝、扩散和交互作用等），及其分布提供理论支持。土壤微生物分布格局包括距离-衰减关系和物种-面积关系等。其中，距离-衰减关系指随着空间距离尺度的增加，微生物群落的空间异质性增加，而其相似性随着空间隔离的出现而降低。物种-面积关系指随着采样面积的增加观测到的物种数量增加。影响土壤微生物分布格局的因素很多。微生物细胞大小可影响其代谢速率和最大生命周期等参数，当前环境条件以及历史偶然因素（土壤pH、温度、碳氮含量和地理隔离等）可影响微生物群落群集、物种形成和灭绝等过程，进而调控微生物地理分布格局，使其同时表现出环境隔离和生物地理区域性模式。