平衡分子动力学（equilibrium molecular dynamics），工学-化工-化学工程-化工热力学-【分子模拟】-分子动力学方法，计算体系处于平衡态下（内部无热力学流）性质的分子动力学模拟方法。在平衡分子动力学方法中，主要依据统计力学中的涨落耗散理论和线性响应理论，采用两个等价的公式来确定体系中粒子的传递性质：基于均方位移的爱因斯坦关系式和基于积分自相关函数的格林-久保关系式。最早应用的平衡分子动力学方法为针对体系能量、体积和粒子数均保持不变的微正则系综分子动力学。但是，大多数实验过程是在温度或压力恒定的情况下进行的，因此为了模拟这些过程，先后又开发出了基于正则、等温等压系综的常用平衡分子动力学模拟方法。在平衡分子动力学方法中，牛顿力学方程可通过经典勒让德变换转化为哈密顿方程，而辛算法是专门用于求解经典哈密顿运动方程的一类数值积分方法。离散化后的差分方程能够保持原有哈密顿系统的辛结构，在长时间、多步数的计算中相较于非辛算法显示出明显的优越性。