化学结构理论（structual theory of chemistry），理学-科学技术史-化学化工史-〔化学术语与理论〕，阐述形成化合物的原子在分子中相互结合、相互影响，以及与该化合物性质之间关系的理论。19世纪前，化学结构的概念还较为模糊，化学家们对于物质的研究一般停留在分析物质（主要是无机化合物）的元素组成上。1803年英国化学家J.道尔顿（John Dalton，1766～1844）建立了化学原子论，化学家们研究的视角开始从分析物质的元素组成转向探讨原子构成。道尔顿原子论认为原子之间的位置关系就是简单地并列在一起。同在1803年，瑞典化学家J.J.贝采利乌斯（Jöns Jacob Berzelius，1779～1848）建立的电化学二元论将化合物的结合方式解释为电性相异的两部分之间的相互吸引。19世纪初期，有机化学逐渐独立，当时的理论对于解释有机物的组成问题收效甚微，化学家们积极寻找新的理论。1832年，德国化学家J.von 李比希（Justus von Liebig，1803～1873）提出的基团理论，将基团看作有机化合物的基本成分，从基团之间的组成关系来认识有机物的组成。