航海疾病监测（navigation disease monitoring），医学-现代医学-综合领域-军事医学-航海医学-舰船饮水消毒，对航海疾病的发生发展进行动态观察分析、信息处理等的活动。目的是科学合理配置航海医学资源、促进对航海人员健康威胁的认知、持续评价航海疾病预防控制措施效果，以达到及早发现航海相关疾病，及早识别航海疾病的暴发和流行，及时采取有效预防控制措施，防止航海疾病的发生、传播和流行，保护航海人员健康。航海疾病的动态分析包括时间动态分布，从健康到发病直至转归的动态分布和地域分布。其影响因素包括影响疾病发生和发展的航海环境及其他自然因素和社会因素。航海疾病监测的人群主要为从事航海活动的职业人群，包括船员、潜水员、渔民等，以及处于航海状态的船舶乘用人。监测的目标包括船舶上发生的传染病及其事件、伤害（意外伤害、环境伤害、敌对行动的伤害等）、中毒、心理应激、精神病及精神障碍、营养代谢性疾病、运动性疾病，以及其他与航海活动有关的疾病。监测信息的报告通常由航海医学专业人员在统一的计划和标准下实施，可以利用通信和网络工具快速传递信息和数据。