核酸侵入分析（nucleicacids invasive analysis），理学-化学-分析化学-生命分析化学-DNA甲基化分析，基于核酸侵入反应的生物检测技术。能够对DNA、RNA、miRNA及蛋白质进行高灵敏、高特异性的测定。核酸侵入反应是由5′核酸内切酶或flap内切酶催化的，能够识别切割核酸片段形成的特异性二叉结构——侵入重叠结构的一类反应。5′核酸内切酶或flap内切酶特异性识别核酸3′末端侵入下游双链所产生的侵入结构，并切割被侵入的下游双链核酸5′翘起片段（见图）。切割所产生的短片段被称为flap或arm片段，能够作为模板特异性的信号分子被检测。核酸侵入反应具有很高的特异性，当反应体系中的核酸片段，没有形成特异的侵入重叠结构时，切割反应几乎不发生，不产生特异的信号分子。高的特异性使该反应可以准确地检测DNA和RNA分子中单碱基突变、插入或缺失，也适用于靶序列的定量研究。