重组融合蛋白（recombinant fusion proteins），理学-生物学-生物工程-基因工程，采用DNA重组技术去除编码一种蛋白质基因的终止密码子，在阅读框内连接带有终止密码子的其他蛋白质编码基因，不同基因在特定的原核或真核宿主细胞内共表达后获得的活性产物。可能包括不同原蛋白的全序列，也可能只包含其部分序列。构建要点在构建重组融合蛋白的过程中，不同蛋白质序列间需要加入设计的接头序列（连接肽），其长度对蛋白质的折叠和稳定十分重要，此外也应考虑连接肽的柔性和疏水性，一般3～8个氨基酸的连接肽符合大部分融合蛋白正确折叠的要求。为了纯化融合蛋白的需要，可以加入谷胱甘肽硫转移酶（GST）或6×组氨酸肽（6×His-tag），以便通过亲和层析等方法纯化融合蛋白。