亲水性通道（hydrophilic microchannel），理学-化学-分析化学-色谱法-微分析系统-纳米通道，带有极性基团的分子，对水有大的亲和能力，可以吸引水分子，或溶解于水的通道。这类分子形成的固体材料的表面，易被水所润湿。具有这种特性都是物质的亲水性。反之，疏水性指的是一个分子（疏水物）与水互相排斥的物理性质。例如，疏水性分子包含有烷烃、油、脂肪和多数含有油脂的物质。微流控芯片材料的制作中主要是以高分子聚合物材料为主，其主要优点在于具有良好的电绝缘性和散热性，同时具有良好的光学性能，对检测信号干扰小或无干扰，制作工艺简单，价格低廉。然而，许多聚合物芯片的表面疏水性很强，无法和水溶性介质相溶。这样的聚合物芯片刻划的通道形成了疏水性通道，它会导致分析物吸附在芯片通道的表面，严重影响了它的分析性能，极大地影响了聚合物芯片应用范围。通常需要将聚合物芯片通道表面进行适当的修饰及改性，在疏水性材料制备的微通道表面修饰极性强的功能基团，使其表面具有亲水性，即可成为亲水性通道(见通道表面修饰)。