生物多样性信息学指利用信息技术， 对生物有机体基础数据的管理和算法的探究、分析和解释，尤其是在物种水平上的应用。它涉及到对信息的收集、存储、提交、检索和分析，主要关注单个有机体、居群和分类群以及它们的相互关系，其内容覆盖了系统学、进化生物学、居群生物学、行为科学，以及从传粉生物学到寄生病学和植物群落学等领域。生物多样性信息学和生物信息学（Bioinformatics）相互联系但又有区别。前者主要关注物种到生态系统水平（Sarkar， 2007， 2009； Paton， 2009）的生命现象，而后者主要关注分子水平上的问题。也有研究者认为生物多样性信息学是生物信息学的一个研究方向（钟扬和张亮，2000）。不管怎样，理解生物多样性信息学研究及其与相关领域关系的问题在于：随着数字化编目、数字化标本馆、数字化植物园等大量研究活动的涌现，我们需要一个整体的知识框架来融合生物学家和技术专家的知识，规范相关的研究活动，一起来讨论、规划这一领域未来的发展蓝图。