球囊菌门(学名:Glomeromycota，AM fungi)，又称聚合菌门、锈球菌门，是真菌界的七个门之一，目前约已发现400种生物。聚合菌可构成陆生植物的丛枝菌根(arbuscular mycorrhizas, AM)，也因此被称为"AM Fungi"。许多证据显示在此共生关系中，聚合菌是绝对共生菌，须依赖植物合成的碳及能量才能生存，但有对某些物种的研究表明聚合菌可能可以单独存在。形成菌根的聚合菌广泛的分布在全世界的土壤中，和植物的根(或苔藓植物的假根)形成共生关系，它们也可以生存在盐度很高的沼泽中，和附生植物形成共生关系。