生物底盘（biological chassis），理学-生物学-生物工程-生物技术-生物技术-合成基因组学，为了实现某些功能的需要，基因组或基因通路被改造后的细胞。原理合成生物学研究主要有3个层次：一是利用现有的天然生物模块构建新的调控网络并表现出新功能；二是采用从头合成的方法人工合成基因组DNA；三是人工创建全新的生物系统乃至生命体。简言之就是生物元件、生物模块和生物底盘3个层次。生物元件是合成生物学最小的研究单位，保证生物元件在不同的环境中都能正常发挥其生物学功能是合成生物学研究最重要的基石，对于元件的研究主要包括元件的设计、构建、功能测试以及标准化。生物模块是由生物元件为了获得某种功能组合而成的，生物元件的组装、模块功能检测和标准化是模块研究的主体内容。生物底盘是承载一或多个模块发挥功能的细胞系统。生物底盘研究的工作主要是最小基因组的构建、代谢流分析、底盘与功能模块的相互作用研究。