柑橘茎点菌是Guignardia属的微生物，原产地为中国。病斑生于果实上，圆形、椭圆形，淡褐色，凹陷，边缘稍隆起，呈红褐色或黑色，直径2-4mm。上生几个小黑点（分生孢子器）；分生孢子器果皮表面生，散生或聚生，出埋生，后突破表皮，孔口外露，球形、扁球形，直径100-150um，高75-100um；器壁膜质，黑褐色，由数层细胞组成，壁厚5-7.5um，内壁无色，形成产孢细胞，上生分生孢子；孔口圆形，胞壁加厚不明显，与器壁同色，剧中；产饱细胞长瓶形，葫芦形，单胞，无色，7.5-12.5×5-7.5um；分生孢子椭圆形、卵圆形，两端钝圆，单胞，无色，6-10×5-6um。