生物污染物是指废水中的致病微生物及其他有害的生物体。主要包括病毒、病菌、寄生虫卵等各剩致病体。此外，废水中若生长有铁菌硫菌、藻类、水草及贝壳类动物时，会堵塞管道、腐蚀金属及恶化水质，也属于生物污染物。引起水体、大气、土壤和食品污染的有害生物，称为生物污染物。它的种类很多，主要有危害人与动物消化系统和呼吸系统能病原菌、寄生虫；引起创伤和烧伤等继发性感染的溶血性链球菌、金黄色葡萄球菌等；以及可引起呼吸道、肠道和皮肤病变的花粉、毛虫毒毛、真菌孢子等大气变应原。大气中常见的生物污染物有杆菌、球菌、霉菌、酵母菌和放线菌等。受生物污染的水体可带有伤寒、痢疾、结核杆菌、螺旋体和病毒，还有吸血虫、痢疾变形虫、线虫、贾第虫以及一些有害昆虫如蚊、舌蝇等的幼虫。土壤中分布最广的生物污染物是肠道致病性原虫和蠕虫类，有的病毒也可通过土壤使人感染。有些微生物如结核杆菌，可在干燥细小的土壤颗粒中长时间存活。生物污染物主要来源于病人、带菌者和病畜、病禽等，通过空气、土壤、水、食品和食具广涉传播。