中国医药工业研究总院于2011年2月26日在上海举行揭牌仪式，由上海医药工业研究院、四川抗菌素工业研究所、上海现代制药股份有限公司、药物制剂国家工程研究中心、国家(上海)新药安全评价研究中心、中国医药工业信息中心等6家国内知名的科研与产业化机构整合而成，隶属于中国医药集团总公司。其战略目标是要建设成为国家医药行业的科技创新基地、中国医药集团总公司的科技创新平台。中国医药工业研究总院的建立，是国务院国资委致力于把中国医药集团打造成"中央企业医药健康产业平台"的重大举措，得到了上海市委、市政府的关注和支持，也引起了医药行业的普遍关注。