佳木斯大学理学院成立于1999年8月，是学校中规模较大、综合实力较强的理科学院。成立初期学院包括6个系部，2004年7月生物科学系分出成立生命科学学院。目前，学院共有5个系部，即:数学系、物理系、资源环境与科学系、基础数学教学部、基础物理教学部;4个本科专业，即:物理学(s)、数学与应用数学(s)、地理科学(s)专业、环境科学专业;1个专科专业:资源环境与城乡规划管理专业;学院现有省级重点专业1个(地理科学)、省级重点课程2门(普通物理、高等数学)、校级精品课程四门(数学分析、高等代数、高等数学、气象学与气候学)，校级重点实验室1个(基础物理实验室)，开放实验室2个(专业物理光学实验室和电磁学