蛋白质相互作用

蛋白质相互作用（protein-protein interaction），理学-物理学-〔物理学与其他学科的交叉〕-分子生物物理学，蛋白质分子之间的相互作用，特别是对蛋白质分子复合体结构、动力学特性以及相应生物功能（如生物过程的信号传导、调控等）有关键作用的物理相互作用。生物体系中蛋白质分子可以与众多的其他分子（包括蛋白质）发生相互作用，其中蛋白质间的相互作用具有重要的生物意义和丰富的物理内容。在系统生物学研究中，还根据蛋白质相互作用的有无等粗粒化信息构建了多尺度的蛋白质相互作用网络结构。这些相互作用常常具有特异性。由于蛋白质相互作用过程需要克服蛋白质分子的平移熵，蛋白质间相互作用常牵涉静电作用、疏水作用等较强的非键相互作用，有时还牵涉硫键等化学键作用。另外，水分子可以通过介导蛋白质之间的氢键网络而直接参与蛋白质相互作用。蛋白质分子之间的特异性界面相互作用通常与蛋白质单元内部的相互作用存在一定程度的自洽性，甚至可以通过蛋白质相互作用诱导本征无序蛋白质分子的折叠，并在蛋白质之间表现出界面形状和化学组成的互补性。这种微观结构上的相互作用特点可以通过解析蛋白质复合物三维结构来确定。