基因表达谱分析(analysis of gene expression profiling),理学-化学-分析化学-生命分析化学,在分子生物学领域借助cDNA、表达序列标签或寡核苷酸芯片等来测定细胞基因表达情况(包括特定基因是否表达、表达丰度,以及基因在不同组织、不同发育阶段、不同生理状态下的表达差异)的方法。根据研究的内容,基因表达图谱分析可以分为三个层次:分析差异基因表达的单基因水平层次,分析基因的共同功能、相互作用的多基因水平层次,建立基因调控网来分析和理解生命现象的系统水平层次。通过一次性测定大量基因构建细胞功能的总体态势图,可以从图谱中区分出正在分裂的细胞,以及细胞对特征性治疗的反应。基因表达谱分析还有助于了解疾病的发病机制、药物的生理反应和治疗效果。例如,肿瘤分类技术高度依赖病理学工作者对肿瘤组织的主观判断,而利用基因表达图谱进行分析,即使一些组织没有显著变化,也能够提供更加客观的判断依据,有利于早期诊断。