先天免疫耐受（natural immune tolerance），医学-现代医学-基础医学领域-医学免疫学-免疫耐受，在个体发育过程中的未成熟T淋巴细胞和B淋巴细胞，接触自身抗原后形成免疫耐受，为避免免疫系统攻击自身组织的最主要机制。如果此机制失效，则很可能导致自身免疫性疾病。先天免疫耐受是美国动物学家R.D.欧文（Ray David Owen，1915～2014）等在1945年首先发现的。他在研究中发现异卵双生小牛由于胎生期胎盘血管相互融合、血液相互交换而形成天然联体共生，出生后，两只孪生小牛体内相互存有对方的血细胞而不排斥，形成血型嵌合体（chimeras of blood type），彼此间相互移植皮肤也不发生排斥，但移植无关小牛的皮肤则被排斥，证明此种耐受具有抗原特异性。这种耐受现象被欧文称为先天免疫耐受。后来证明先天免疫耐受是一种生理现象，在个体发育过程中，未成熟的T淋巴细胞和B淋巴细胞，接触自身抗原后可通过克隆清除或克隆失能等机制形成对自身抗原的免疫耐受，使机体的免疫系统获得鉴别“自我”与“非我”的能力，正常情况下对自身成分不发生免疫应答，从而保持机体的稳定性。