凝胶色谱分离（gel permeation chromatography），工学-化工-化学工程-传质分离过程-传质分离方法-色谱分离，以多孔性凝胶为固定相，依靠尺寸排阻效应分离或纯化不同分子量物质的色谱分离。又称尺寸排阻色谱。凝胶色谱分离作为固定相凝胶具有一系列大小不同的孔道。当样品分子进入凝胶时，分子量越高，尺寸越大，能够进入的孔道就越少，就能越快流出。反之，分子量低，分子尺寸小，在固定相中能够进入的孔道多，保留时间越长。样品分子按照分子量从高到低的顺序流出色谱柱，实现分离的目的。按照流动相不同，凝胶色谱可分为以水为流动相的凝胶过滤色谱和以有机溶剂为流动相的凝胶渗透色谱。凝胶色谱分离主要用于大分子的分离纯化，包括蛋白质和核酸的分离纯化、脱盐等，甚至可以分离处于不同折叠状态的同种蛋白质。凝胶色谱分离的优势是可实现大分子与小分子的分离，且洗脱剂用量一般较少，对样品稀释程度小，适用于易失活的生物大分子的纯化。由于固定相与样品分子之间的相互作用力小，样品分子不会因难洗脱而损失，固定相也不易被污染。其主要缺陷在于柱效不高，不同分子的分子量需要相差较大才能实现理想的分离。