敦煌医学文献（medical manuscripts from the Dunhuang Caves），医学-中医药-﹝医史文献﹞-﹝中医文献﹞，以中国甘肃敦煌莫高窟所藏医学卷子本为主的一批出土的隋唐及其以前的医学文献。在敦煌发现的古文献中，纪年最早的《十诵波罗提本叉戒本》1900年，在甘肃敦煌莫高窟藏经洞发现4万余件手写本和少量的木刻本。相关学者对其进行了大量的整理研究，成果斐然，以至形成了新兴的国际显学—敦煌学。医学文献只占敦煌文献的很小一部分。自敦煌文献被发现之后，又陆续在新疆、甘肃、青海、四川等地发现了许多古卷写本，其中也有少量医学文献。现代学者一般将它们都归入敦煌医学文献进行研究。敦煌文献除中国国家图书馆藏有一万余卷之外，其余都为当时英、法、俄、日等国探险者所获，收藏于英国国家图书馆、法国国立图书馆，以及德国、俄国、日本、美国、印度等国。经调查研究，现存的敦煌医学卷子约有93种，内容涉及医经、五脏、诊法、伤寒、医方、本草、针灸、养生等方面。这些医学文献多撰成于六朝及以前，也有部分系隋唐时期的医学文献。