反向选择（counter selection），理学-生物学-遗传学-遗传学-动物遗传学-上位分析，将反向选择标记基因导入受体细胞，在一定的筛选条件下，带有反向选择标记基因的细胞株不能生长，而不带有反向选择标记基因的细胞株则能够生长，从而对目的基因的转化子进行无选择标记的筛选。起源基因敲除是常用的遗传学研究手段，是鉴定基因生物学功能的主要方法。基因敲除方法分为正向选择和反向选择。正向选择是使用抗生素抗性基因替代靶基因。由于抗生素抗性基因插入可能引发极性效应而影响下游基因表达，因此正向选择的基因敲除方法可能影响正确判断靶基因的生物学功能。为克服正向选择方法的局限，产生了无选择标记的反向选择的基因打靶方法。